เต่าทั้งสี่เดินทางย้อนเวลากลับไปสู่ยุคของซามูไรในตำนานและมฤตยูในญี่ปุ่นโบราณที่ซึ่งพวกเขาฝึกฝนเพื่อให้สมบูรณ์แบบในการเป็นหนึ่งเดียว เต่ายังช่วยเหลือหมู่บ้านเล็ก ๆ ในการลุกฮือ
Ancient Japan, 1393. Without a map. Without a clue. Without a pizza. The international phenomenon that is the Teenage Mutant Ninja Turtles, returns for a daring trip back in time. When their closest friend April O’Neil is accidentally transported to 17th century Japan, the Turtles spring into action, using a mysterious scepter to travel after her. Cowabunga. What they discover is they’ve landed right in the middle of a rebel samurai war. Now, with precious time on their side, they must save April and survive the deadly battle before it spills over into present day New York City.