เมื่อฉลามยักษ์จากทะเลลึกตัวหนึ่งเข้าบุกรุกฐานทัพกลางทะเล กองทหารทั่วโลกจึงออกคำสั่งเตือนประชาชน และวางกองกำลังหนาแน่น เมื่อถึงภาวะฉุกเฉิน รัฐบาลของสหรัฐอเมริกาจึงเปิดเผยโปรเจ็คลับ ที่นักวิทยาศาสตร์ได้สร้างขึ้นมา เพื่อต่อกรกับฉลามยักษ์ซึ่งก็คือ “ฉลามจักรกล” แต่แล้วก็เกิดการผิดพลาด เมื่อฉลามจักรกลทำร้ายมนุษย์และทุกอย่างที่ขวางหน้านักวิทยาศาสตร์จึงหาทางให้เจ้าฉลามยักษ์มาประจันหน้ากับฉลามจักรกลเพื่อต่อสู้กันเอง หากไม่เช่นนั้นแล้ว โลกนั่นแหละที่จะเป็นฝ่ายพินาศ
Nothing can stop the mighty Mega-Shark; not even the colossal sauroid in Mega Shark vs. Crocosaurus (2010). This time, the apex predator of the ocean wreaks havoc in the Port of Alexandria in Egypt; but, the U.S. Navy and the engineer, Jack Turner, have come up with an ambitious solution to this devastating problem: an AI-powered, autonomous shark-like submarine named the Mecha-Shark. Now, for the first time in a long while, humankind has an all-powerful champion on its side to crush the underwater menace; however, after a disappointing first encounter with the living terror of the sea, man’s creation and Megalodon engage in battle, threatening to level Sydney. Can Jack find a way to avert the ultimate battle between Mega-Shark and Mecha-Shark? Written by Nick Riganas